طبق گزارشي كه ”الشرق الاوسط“ به آن دست يافت قاضي دادگاه جزايي نيويورك جرج دانيلز در میان متهمان پرونده ۱۱ سپتامبر بعد از اسامه بن لادن رهبر القاعده علي خامنه‌اي رهبر رژیم ایران و حزب الله لبنان را در رديفهای دوم و سوم متهمان به طراحی و تأمین مالی و اجرای حملات تروریستی 11 سپتامبر 2001 قرار داده است.
این روزنامه در ادامه گزارشهای مستند خود از دادگاه نیویورک نوشت: يك منبع قضايي عاليرتبه به ”الشرق الاوسط“ گفت: ”دولت آمريكا در مورد ارتباط بين رژیم ايران و القاعده قبل و بعد از 11 سپتامبر اطلاع كامل دارد. كه مهمترين آنها اسناد آژانس امنيت ملي است“.