به دنبال برملا شدن چندین حساب بانکی سردژخیم قضاییه خامنه‌ای و اظهارات جعفری دولت‌آبادی دادستان رژیم در تهران برای توجیه این فضیحت، فائزه رفسنجانی گفت: «این که می‌گویند این حسابها در زمان آقای یزدی و شاهرودی هم وجود داشته و با آقا (رهبر نظام) هماهنگ کرده بودند، این تخلف را توجیه نمی‌کند، این‌که حساب شخصی باشد و پول دولتی به آن واریز شود، آن هم با یک امضاء، حتی اگر هیچ‌گونه خطایی صورت نگرفته باشد خلاف است، و بهتر است جعفری دولت‌آبادی و دیگر مسئولان هم به جای این‌گونه موضع‌گیریها و جرم دانستن بیان این موارد پاسخی منطقی بدهند و جلوی این تخلفات را بگیرند».
رسانه‌های حکومتی که مصاحبه فائزه هاشمی را درج کرده‌اند، همچنین نوشتند: «فائزه هاشمی رفسنجانی در ارتباط با عدم استقلال قوه قضاییه گفت، قوه قضاییه نباید تحت‌تاثیر نهادها و ارگانهای دیگر باشد، به‌عنوان مثال، در مورد پرونده محمدعلی طاهری با این‌که منع تعقیب ایشان صادر شده، سپاه مانع از آزادی آقای طاهری می‌شود».
فائزه رفسنجانی همچنین گفت: «نمی‌توانیم بگوییم قطعنامه‌های (سازمان ملل و محکومیت نقض حقوق‌بشر در ایران) اشتباه است، درست می‌باشد و حقوق‌بشر در مواردی که در این قطعنامه آمده واقعاً نقض شده، حداقل دلمان برای مردم خود بسوزد و آن‌گونه باید عمل کنیم که نگذاریم کار به سازمان ملل و سایر ارگانهای بین‌المللی بکشد».